R数据可视化手册（高清PDF下载）

内容提要

R 具有强大的统计计算功能和便捷的数据可视化系统。本书重点讲解 R 的绘图系统，指导读者通过绘图系统实现数据可视化。

书中提供了快速绘制高质量图形的 150多种技巧，每个技巧用来解决一个特定的绘图需求。读者可以通过目录快速定位到自己遇到的问题，查阅相应的解决方案。同时，作者在大部分的技巧之后会进行一些讨论和延伸，介绍一些总结出的绘图技巧。

本书侧重于解决具体问题，是 R 数据可视化的实战秘籍。本书中绝大多数的绘图案例都是以强大、灵活制图而著称的R 包 ggplot2 实现的，充分展现了ggplot2 生动、翔实的一面。从如何画点图、线图、柱状图，到如何添加注解、修改坐标轴和图例，再到分面的使用和颜色的选取等，本书都有清晰的讲解。虽然本书的大多数技巧使用的是 ggplot2，但是并不仅仅局限于ggplot2 的介绍。作者的理念是用合适的工具来完成合适的绘图任务，读者也可以学到许多其他有用的绘图函数和工具，来适应各种复杂的需求。

本书是学习 R中丰富的数据可视化方法的权威手册，非常适合对 R 语言有基本的了解的读者阅读。

前言

几年前读研时我开始用 R，主要用来分析我在科研工作中收集到的数据。我使用 R 首先是想摆脱 SPSS 这样的统计软件的禁锢，即严格的环境和死板的分析。更何况，R是免费的，所以我用不着说服别人为我购买一套这样的软件———这对—个穷研究生来说是相当的重要!此后，随着我对 R的了解不断深入，我才发现原来 R还可以绘制出非常优秀、动人的数据图形。

本书的每个"技巧"中，都列出了一个问题和对应的解决方法。在大多数情况下，我提供的并不是 R 中唯一的实现方法，但却是我认为的最佳方案。R 如此受欢迎的一个重要原因是它有很多附加的软件包，每一个软件包都为 R 提供了一些独特的功能。在 R 中也有很多可视化方面的软件包，但本书主要使用ggplot2（声明∶我现在工作的一部分就是开发ggplot2; 但是，在我还没意识到我可能会从事与 ggplot2 相关的工作之前，我已经完成了本书的大部分工作）。

本书并不想罗列五花八门的方法，成为 R 数据可视化的综合手册;但是我希望当你想绘制所需图形的时候，本书能够对你有所帮助。或者说，当你不知道怎么画的时候，翻一翻这本书或许就可以找到一些可行的方案。

方法

本书面向的读者需要对 R至少有一些基本的了解。书中的技巧会让你明白如何解决一些特定的问题。在使用例子的时候，我力图简单明了，这样你就会明白它们的工作机理，并可以方便地把解决方法应用到自己的问题上。

软件和平台说明

书中的大部分"技巧"都是用 ggplot2 完成的，有些"技巧"需要 ggplot2 的最新版本 0.9.3，这样也就要求有一个版本相对较新的 R——你可以在 R 的官方网站获取最新版本的R。

安装了R后，你可以再安装一些必要的包。除了ggplot2 之外，你还可以选择安装 gcookbook 包（它包含了本书大多数例子的数据集）。要同时安装这两个包，只需运行命令;

install.packages ("ggplot2") 
install.packages("gcookbook")

你可能会被问到选择 CRAN（Comprehensive R Archive Network）镜像的问题。一般而言，任何一个镜像都可以正常工作，不过最好选择一个离你更近的，因为这样速度会更快。安装完包后，每次需要使用 ggplot2 包时在 R 会话中运行∶

library (ggplot2)

本书中的技巧总是假设你已经加载了 ggplot2，所以不会显示这一行代码。如果你看到这样的错误，意味着你忘记了加载 ggplot2。

错误∶找不到函数"ggplot"

英文版 R的错误提示是∶

Error: could not find function "ggplot"

R的主要运行平台是 Mac OS X、Linux 和 Windows，本书中所有的"技巧"都可以在这些平台上运行。在保存位图输出的时候，会有平台的差异，详情参见第 14 章。

本书的排版约定本书采用的体例如下∶

·等宽字体（constant width）;表示程序清单，以及段落中引用的程序元素，如变量或函数名、数据库、数据类型、环境变量、语句和关键字。

·加粗的等宽字体（Constant width bold）∶表示需要用户手动输入的命令或其他文本。

·斜的等宽字体（Constant width italic）∶表示应该用用户所提供的值或根据上下文确定的值来替换的文本。

代码示例的使用

本书的目标是帮助你完成工作。一般而言，你可以在自己的程序和文档中使用本书中的代码， 如果你要复制的不是很大一部分代码，则无须取得我们的许可。例如，你可以在程序中使用本书中的多个代码块，无须获取我们许可。但是，要销售或分发来源于 O'Reilly 图书中的示例的光盘则必须得到许可。通过引用本书中的示例代码来回答问题时，不需要事先获得我们的许可。但是，如果你的产品文档中融合了本书中的大量示例代码，则需要取得我们的许可。

第1章 R基础

本章包括以下基础知识∶ 安装包、使用包和加载数据。

如果你想快速上手，本书大多数技巧都需要安装 ggplot2 和gcookbook 包。运行下面命令来安装∶

install.packages (c ("gplcookbaok"))

然后，在每个 R 会话中，你需要在运行本书的例子之前先加载它们;

library (ggplot2)
library (gcookbook)

R中的包是一些为了便于分发和传播而封装在一起的函数和（或）数据集（可以没有数据集）的集合。在你的电脑中安装软件包，便可以扩展R 的功能。如果一个R 用户编写了一个包并觉得这个包对其他R用户可能有用，那么，这位R用户就可以通过软件包仓库将该包发布。发布 R 软件包的最主要的软件包仓库是 CRAN（Comprehensive R Archive Network），不过也有其他的仓库，如 Bioconductor 和 Omegahat。

1.1 安装包问题

如何从 CRAN 安装 R 包?方法

使用instal1.packages（）函数来安装包，括号中写上要安装的包名。以安装ggplot2 包为例，运行∶

install.packages ("gplot2")

此时系统可能提示你选择一个下载镜像，可以选择离你最近的一个;如果想要确保包的版本是最新的，那就选择 Austria 站点，因为这是 CRAN 的主服务器。

讨论

当 R 安装一个包的时候，该包依赖的所有包也都会被自动安装。

CRAN 是R包的仓库，在全球范围内有很多镜像，它是 R默认使用的库。此外，还有几个软件包仓库，如 Bioconductor，它是与基因组数据分析相关的包的软件包仓库。

1.2 加载包问题

如何加载一个已经安装了的包?

方法

使用library（）函数，括号中写上要加载的包名。以加载 ggplot2包为例，运行∶

library(gplot2)

当然，必须确保要加载的包已经被安装了。

讨论

本书的大多数技巧都需要在运行代码前加载包，无论是为了绘图（ggplot2 包）还是为了加载例子中的数据集（MASS 和 gcookbook 包）。

R的一个不寻常之处是软件包（package）和软件库（library）的术语区别。 尽管我们使用 1ibrary（）函数来加载包（package），但一个包并不是一个软件库;如果你不幸犯此错误，可能会激怒一些资深的 R用户。

软件库指的是—个包含了若干软件包的目录。你既可以拥有一个系统级别的软件库，也可以针对每个用户单独设立一个软件库。

1.3 加载分隔符式的文本文件问题

如何加载一个分隔符式的文本文件中的数据?

【下载地址】

链接：https://pan.baidu.com/s/1qkgwFbJCRFoaUJcxoYWbhg

提取码：w9su